• 生物质热化学转化研究室
• 生物质能生化转化研究室
• 生物质催化转化研究室
• 废弃物处理与资源化利用研究室
• 城乡矿山集成技术研究室
• 能源化工研究室
• 地热能研究室
• 海洋能研究室
• 太阳能研究室
• 先进能源系统研究室
• 分布式发电微电网技术研究室
• 环境能源材料研究室
• 有机能源材料研究室
• 储能技术研究室
• 燃烧与热流研究室
• 制氢与利用研究室
• 能源战略与低碳发展研究室
• 人工环境节能技术研究室
• 分析测试中心